Mesmo distantes do litoral, impactos em bacias de drenagem afetam diretamente processos ambientais e atividades socioeconômicas na zona costeira. Por exemplo, o represamento de rios causa retenção de sedimentos, alteração do fluxo de nutrientes, diminuição da descarga de água doce em estuários e áreas costeiras, gerando vários impactos como a erosão e diminuição do fluxo de sedimentos e de nutrientes, alteração de cadeias alimentares, diminuição da produtividade pesqueira e a sedimentação de estuários por areias marinhas.

O desmatamento, a agricultura, a pecuária e a urbanização facilitam o processo de erosão ao longo das bacias de drenagem, alteram o balanço de sedimentos, aumentam a carga de nutrientes e poluentes ao longo da bacia de drenagem e afetam a zona costeira seja pela contaminação de recursos pesqueiros, depreciação de produtos da maricultura, eutrofização, salinização dos estuários etc.

As bacias de drenagem e as zonas costeiras atuam como receptores finais de resíduos tornando essas regiões vulneráveis a atividades antrópicas e a sensibilidade dessas regiões vai depender das características ecológicas e biogeoquímicas de cada ambiente, principalmente do tempo de residência das águas e da sua capacidade de diluição.

BIDONE, E. D., 2000. Análise econômica-ambiental aplicada à contaminação de águas fluviais de pequenas bacias costeiras do Estado do Rio de Janeiro. Ecologia de Restingas e Lagoas Costeiras. Ed. UFRJ, Rio de Janeiro. 
 

FIDELMAN, P.I.J., 1998. Estudo de Impacto Ambiental da Barragem do Rio Santana, Ilhéus, Bahia: Análise Crítica. In: Livro de Resumos Expandidos da XI Semana Nacional de Oceanografia, Rio Grande-RS. Pelotas: Universitária/UFPel.